データセット ID
JGAD000060
- データの種類
- NGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 1.5 TB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0066
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000060 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000060 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 大腸がん：9症例（84検体 [腫瘍組織：71検体、肝転移巣：4検体、非腫瘍組織：9検体]）
- 健康状態混在
- 対象者数9 (人数)
- 試料説明
- 大腸がん症例の腫瘍組織、非腫瘍組織、および肝転移巣より抽出したDNA
- 組織肝臓
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V4
SureSelect Human All Exon V5 - 断片化
- 超音波断片化（Covaris）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp