データセット ID
JGAD000036
- データの種類
- RMSおよびPPBのNGS（Exome）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 534 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0035
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000036 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000036 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- RMS：16症例、PPB：7症例
- 健康状態混在
- 対象者数23 (人数)
- 年齢層小児
- 試料説明
- 小児横紋筋肉腫、胸膜肺芽腫、小児膵芽腫の腫瘍組織、および対応する末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon
- 断片化
- 超音波断片化（Covaris S220）
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
Illumina HiSeq 2500 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 75–108 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- 表現型データの有無
- あり
- European Genome-phenome Archive Accession
- EGAD00001000822 / EGAS00001000662（PPB）
EGAD00001001105 / EGAS00001000884（RMS）