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NBDC ヒトデータベース
JGAD000035
公開日
2020-09-28

更新日
2020-09-28

研究
hum0037

データの種類
NGS(Exome)

アクセス制限
制限公開(Type I)

JGA Study
JGAS000035

解析手法

WES

材料と対象者

RA患者: 39症例 男性健常人5名分の検体をプールしたサンプル: 1 女性健常人5名分の検体をプールしたサンプル: 1

実験方法

Exome

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2000]

試料説明

末梢血から抽出したgDNA

ライブラリ構築

SureSelect Human All Exon 50 Mb Kit(Agilent社)

断片化

超音波断片化(Covaris)

リードタイプ

Paired-end

リード長

100 bp

JGAデータセットAccession

JGAD000035 (GRCh37_decoy)

総データ量

680 GB(bam)、143 MB(vcf)*1

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