データセット ID
JGAD000035
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 730 GB
- ファイル形式
- BAM
- VCF
- 研究
- hum0037
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000035 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000035 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- RA患者:39症例
男性健常人5名分の検体をプールしたサンプル:1
女性健常人5名分の検体をプールしたサンプル:1 - 健康状態混在
- 対象者数49 (混在)
- 性別混在
- 試料説明
- 末梢血から抽出したgDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon 50Mb
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- 加工データの種類
- 変異コール