データセット ID
JGAD000024
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 15.8 GB
- ファイル形式
- BAM
- VCF
- 研究
- hum0027
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-11-18
- DDBJ Search
- JGAD000024 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000024 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- 侵襲性歯周炎患者: 1症例
- 健康状態罹患
- 対象者数1 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- 末梢血から抽出したDNA
- 組織末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect Human All Exon V5
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris E220)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- NCBI36
- 表現型データの有無
- あり