データセット ID
JGAD000017
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開(Type I)
- 総データ量
- 12.6 GB
- ファイル形式
- BAM
- 研究
- hum0022
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
- JGAD000017 (新しいタブで開きます)
- JGA Study
- JGAS000017 (新しいタブで開きます)
解析手法
WES
- 材料と対象者
- DCL患者1症例(白血病、その寛解期、再発期、ドナー由来白血病後期)および移植ドナー1名(正常末梢血)
- 健康状態混在
- 対象者数2 (人数)
- 試料説明
- 骨髄中白血病細胞および末梢血から抽出したDNA
BM-P1 白血病、BM-P2 寛解期、BM-P3 再発期、BM-P4 ドナー由来白血病後期、BM-D1 移植ドナー末梢血 - 組織骨髄、口腔粘膜、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍混在
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- WES
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SureSelect
- 断片化
- 超音波断片化(Covaris S220)
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 100 bp
- 参照ゲノム
- GRCh37
- 表現型データの有無
- あり