2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
JGAD000017
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- 研究
- hum0022
- データの種類
- NGS(Exome)
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- JGA Study
- JGAS000017
解析手法
WES
- 材料と対象者
DCL患者1症例(白血病、その寛解期、再発期、ドナー由来白血病後期)および移植ドナー1名(正常末梢血)
- 実験方法
Exome
- プラットフォーム
Illumina [HiSeq 2000]
- 試料説明
骨髄中白血病細胞および末梢血から抽出したDNA
- ライブラリ構築
SureSelect Kit
- 断片化
超音波断片化(Covaris S220)
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
100 bp
- JGAデータセットAccession
JGAD000017 (BM-P1 白血病、BM-P2 寛解期、BM-P3 再発期、BM-P4 ドナー由来白血病後期、BM-D1 移植ドナー末梢血)
- 総データ量
500 GB(bam [ref: GRCh37])
- 利用ポリシー