データセット ID
JGAD000005
- データの種類
- NGS（RNA-seq）
- アクセス制限
- 制限公開（Type I）
- 総データ量
- 12.2 GB
- ファイル形式
- CSFASTA
- QUAL
- 研究
- hum0007
- 公開日
- 2020-09-28
- 更新日
- 2020-09-28
- DDBJ Search
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- JGA Study
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解析手法
RNA-seq
- 材料と対象者
- 健常者1名（ナイーブT細胞、Th1細胞、inactive-Th17、active-Th17）
- 健康状態健常
- 対象者数1 (人数)
- 対象集団日本人
- 試料説明
- ヒト末梢血リンパ球から調整した免疫細胞（ナイーブCD4+ T細胞、Th1細胞、活性化前CD161+Th17 細胞、活性化後CD161+Th17細胞）からRNAを抽出
Th17細胞の活性化については、IL-1βとIL-23を用いたTh17誘導刺激を実施 - 組織CD161+ Th17 cell、リンパ球、Naive CD4+ T cell、末梢血、Th1 cell
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- SOLiD SAGE Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Applied Biosystems 5500 Genetic Analyzer
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 35 bp