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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

E-GEAD-1053

データの種類
NGS(scRNA-seq、scATAC-seq)
アクセス制限
非制限公開
総データ量
347 GB
ファイル形式
  • TXT
  • TAR
研究
hum0290
公開日
2025-05-19
更新日
2026-10-02

解析手法

scRNA-seq + scATAC-seq

材料と対象者
健常者:94名(125検体)
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    94 (人数)
試料説明
末梢血より単離した細胞から抽出したDNAおよびRNA
  • 組織
    末梢血
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
試料の入手元
N/A
実験方法
scATAC-seq
scRNA-seq
測定対象
N/A
試薬キット
Chromium Next GEM Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
断片化
酵素反応
プラットフォーム
Illumina NovaSeq 6000
Illumina NovaSeq X
リードタイプ
ペアエンド
リード長
scRNA-seq: 118 bp
scATAC-seq: 99 bp
参照ゲノム
GRCh38
解析方法
CellRanger-arc(ver2.0.0)