データセット ID
DRA020399
- データの種類
- NGS（scRNA-seq）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 834 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0416
- 公開日
- 2025-04-25
- 更新日
- 2025-04-22
- DDBJ Search
- DRA020399 (新しいタブで開きます)
解析手法
scRNA-seq
- 材料と対象者
- シェーグレン症候群（ICD10：M35.0）：12症例
唾液腺：12検体 - 健康状態罹患
- 対象者数12 (人数)
- 疾患
- シェーグレン症候群
- 試料説明
- 唾液腺検体より分離した単細胞から抽出したmRNA
- 組織唾液腺
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- scRNA-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- BD Rhapsody WTA Reagent Kit
- 断片化
- 酵素反応
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq 2500
Illumina NovaSeq 6000 - リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 150 bp
- 参照ゲノム
- GRCh38
- QC・フィルタリング
- Cell Ranger Metrics
- 解析方法
- BD Rhapsody Sequence Analysis Pipeline（version 1.12）