データセット ID
DRA017833
- データの種類
- NGS（Target RNA-seq、TCR-seq）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 54.1 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0443
- 公開日
- 2024-04-26
- 更新日
- 2024-05-14
- DDBJ Search
- DRA017833 (新しいタブで開きます)
解析手法
Target RNA-seq
- 材料と対象者
- 正常妊娠：7名（初期4名、後期3名）
妊娠高血圧腎症（ICD10：O149）：3症例
正常妊娠初期脱落膜CD4+T細胞：4検体
正常妊娠後期脱落膜CD4+T細胞：3検体
妊娠高血圧腎症脱落膜CD4+T細胞：3検体
正常妊娠後期末梢血CD4+T細胞：1検体 - 健康状態混在
- 対象者数10 (混在)
- 性別女性
- 疾患
- 妊娠高血圧腎症
- 試料説明
- 脱落膜・末梢血より分取したCD4+T細胞から抽出したRNA
- 組織脱落膜、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- RNA-seq
- 測定対象
- 1) BD Rhapsody T Cell Expression Panel Hs (BD Biosciences Cat#633751)
2) Rhapsody Supplemental Gene Primer for IL10 and NRP1.
3) T cell receptor - 試薬キット
- BD Rhapsody Targeted mRNA and AbSeq Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 531 bp (平均)
TCR-seq
- 材料と対象者
- 正常妊娠：3名（初期2名、後期1名）
妊娠高血圧腎症（ICD10：O149）：1症例
正常妊娠初期脱落膜：2検体
正常妊娠後期脱落膜：1検体
正常妊娠後期末梢血：1検体
妊娠高血圧腎症脱落膜：1検体 - 健康状態混在
- 対象者数4 (人数)
- 性別女性
- 疾患
- 妊娠高血圧腎症
- 試料説明
- 脱落膜・末梢血より分取したCD4+T細胞から抽出したRNA
- 組織脱落膜、末梢血
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 試料の入手元
- N/A
- 実験方法
- TCR-seq
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- BD Rhapsody Targeted mRNA and AbSeq Kit
- 断片化
- N/A
- プラットフォーム
- Illumina NovaSeq 6000
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- TCRα: 659 bp (平均)
TCRβ: 655 bp (平均) - 表現型データの有無
- あり