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NBDC ヒトデータベース

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現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

DRA014186

データの種類
微生物ゲノムのMAG・ウイルスのゲノム配列・CRISPR spacer配列
アクセス制限
非制限公開
総データ量
113 B
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0197
公開日
2022-06-06
更新日
2022-06-07

解析手法

Metagenomics

材料と対象者
  • 対象集団
    日本人
試料説明
  • 組織
    腸内細菌叢
実験方法
Metagenomics
プラットフォーム
Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000
解析方法
metaspades,dastools(metabat2、maxbin2、concoct)によるde novo assembly + binning
加工データの種類
メタゲノムから再構成したゲノム (MAG)

NGS (WGS)

材料と対象者
  • 対象集団
    日本人
試料説明
  • 組織
    腸内細菌叢
実験方法
Metagenomics
プラットフォーム
Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 3000
Illumina NovaSeq 6000
解析方法
MAG配列に対してMINCEDを適用。