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NBDC ヒトデータベース

カートに入れたデータセットはありません。

システムメンテナンスに伴い、以下の日程で、NBDCヒトデータベース申請システムならびにヒトデータ審査委員会による審査が停止いたします。
停止期間:2026年10月5日(月) 9:00 ~ 10月7日(水) 15:00
ご迷惑をおかけしますが、どうぞ宜しくお願いいたします。

現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします

データセット ID

DRA007336

データの種類
NGS(WGS)
アクセス制限
非制限公開
総データ量
605 GB
ファイル形式
  • FASTQ
研究
hum0122
公開日
2019-11-14
更新日
2019-11-14

解析手法

WGS

材料と対象者
ヒト臍帯血由来単核細胞(タカラバイオD10118):4検体(CB_1, CB_2-1, CB_2-2, CB_2-3)
- CB_1から誘導したiPS細胞:5検体
- CB_2-1から誘導したiPS細胞:3検体
- CB_2-2から誘導したiPS細胞:3検体
- CB_2-3から誘導したiPS細胞:3検体
成人皮膚線維芽細胞(クラボウKF4109):1検体(adult human dermal fibroblast [HDFa])
- HDFaから誘導したiPS細胞:8検体
  • 健康状態
    健常
  • 対象者数
    27 (検体数)
  • 年齢層
    成人
試料説明
樹立したiPS細胞、および樹立に用いた購入細胞それぞれから抽出したDNA
  • 組織
    臍帯血、Cord blood mononuclear cell、Dermal fibroblast、iPS 細胞
  • 腫瘍 / 非腫瘍
    非腫瘍
細胞株
Cord blood mononuclear cell (TaKaRa D10118)
HDFa (KURABO KF4109)
実験方法
WGS
測定対象
N/A
試薬キット
TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
断片化
超音波断片化
プラットフォーム
Illumina HiSeq X
リードタイプ
ペアエンド
リード長
400 bp