データセット ID
DRA006622
- データの種類
- NGS（WGS）
- アクセス制限
- 非制限公開
- 総データ量
- 333 GB
- ファイル形式
- FASTQ
- 研究
- hum0122
- 公開日
- 2019-11-14
- 更新日
- 2019-11-14
- DDBJ Search
- DRA006622 (新しいタブで開きます)
解析手法
WGS
- 材料と対象者
- ヒト臍帯血由来単核細胞（タカラバイオD10118）：4検体（CB_1, CB_2-1, CB_2-2, CB_2-3）
- CB_1から誘導したiPS細胞：5検体
- CB_2-1から誘導したiPS細胞：3検体
- CB_2-2から誘導したiPS細胞：3検体
- CB_2-3から誘導したiPS細胞：3検体
成人皮膚線維芽細胞（クラボウKF4109）：1検体（adult human dermal fibroblast [HDFa]）
- HDFaから誘導したiPS細胞：8検体 - 健康状態健常
- 対象者数27 (検体数)
- 年齢層混在
- 試料説明
- 樹立したiPS細胞、および樹立に用いた購入細胞それぞれから抽出したDNA
- 組織臍帯血、Cord blood mononuclear cell、Dermal fibroblast、iPS 細胞
- 腫瘍 / 非腫瘍非腫瘍
- 細胞株
- Cord blood mononuclear cell (TaKaRa D10118)
HDFa (KURABO KF4109) - 実験方法
- WGS
- 測定対象
- N/A
- 試薬キット
- TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit
- 断片化
- 超音波断片化
- プラットフォーム
- Illumina HiSeq X
- リードタイプ
- ペアエンド
- リード長
- 400 bp