2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
- 公開日
- 2015-07-01
- 更新日
- 2015-08-01
- 研究
- hum0036
- データの種類
- NGS (Exome)
- アクセス制限
- 非制限公開
解析手法
WES
- 材料と対象者
コリエル医学研究所より購入したHapMap-JPT検体由来のセルライン: 2名分
- 実験方法
Exome
- プラットフォーム
Illumina [HiSeq 2500]
- ライブラリ構築
Roche/NimbleGen [SeqCap EZ Human Exome Library v3.0] Illumina [Nextera Rapid Capture Exome(v1.2)] Agilent [SureSelect XT Human All Exon v5] Agilent [SureSelect QXT Human All Exon v5]
- 断片化
Roche/NimbleGen [SeqCap EZ Human Exome Library v3.0]: 超音波断片化(Covaris) Illumina [Nextera Rapid Capture Exome (v1.2)]: 酵素反応を用いた断片化(トランスポゾーム ) Agilent [SureSelect XT Human All Exon v5]: 超音波断片化(Covaris) Agilent [SureSelect QXT Human All Exon v5]: 酵素反応を用いた断片化(トランスポゾーム )
- リードタイプ
Paired-end
- リード長
161 bp x 2
- Sequence Read Archive Accession
- 総データ量
65 GB(fastq)
- 利用ポリシー