2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします：2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 胃がん組織から同定された遺伝子変異を腫瘍由来血漿中循環DNA (ctDNA) としてモニタリングし、個別化腫瘍マーカーとしてのctDNAの臨床的妥当性を検証する
研究方法: 登録された10症例から、術前および術後の血漿、原発腫瘍組織、末梢血単核細胞 (PBMC) を採取した。 原発腫瘍標本は手術直後に3箇所から採取し、すべての標本の細胞密度が顕微鏡下で30％以上であることを確認した。 30の原発腫瘍組織および10のPBMCから抽出したDNAを用いた、がん関連151遺伝子のtarget capture sequencingを実施した。
対象: 胃がんの術前診断においてStage IB以上と診断された症例のうち、書面での同意が得られた10症例
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
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| JGAD000325 | 制限公開（Type I） | NGS(Target Capture) | 2020-09-28 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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| 科学研究費助成事業 新学術領域研究 (研究領域提案型) | 薬剤耐性癌細胞の多様性に対応する至適分子標的薬選定プロセスの体系化 |
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| 科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金 (国際共同研究強化) | 薬剤耐性コロニーをモデルとした癌再発抑制へ繋がる化合物同定に関する研究 (国際共同研究強化) |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | Circulating tumor DNA検査の臨床導入における課題点の克服 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | Helicobacter pylori免疫応答が胃癌術後補助化学療法に及ぼす影響 |
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| 科学研究費助成事業 基盤研究 (C) | 血漿中遊離変異DNA定量による食道癌モニタリングシステムの開発 |
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タイトル | DOI | データセット |
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| Analysis of mutational and proteomic heterogeneity of gastric cancer suggests an effective pipeline to monitor post-treatment tumor burden using circulating tumor DNA | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0239966 | |
名前 | 所属機関 | 国 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット一覧 |
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| データなし | |||||