研究題目
シークエンス解析によるがんゲノム研究:食道がん
研究概要
目的: 日本人の食道がんにおけるゲノム変異を探索する
研究方法: 食道がん切除切片における非腫瘍組織 (正常組織) および腫瘍組織より抽出したDNAを使用したNGSライブラリーを作成後、Illumina HiSeq 2000/2500/X Fiveにて塩基配列を決定する。
対象: 食道がん患者の非腫瘍組織および腫瘍組織のDNA

2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
NBDC ヒトデータベース申請業務ならびにJGA関係の業務につきまして、以下の期間休業いたします:2026年8月12日(水) 〜 2026年8月17日(月) 休業期間中にいただいた申請やお問い合わせ等は、休業明けの 8月18日(火) より順次対応させていただきます。 上記休業期間の前後は通常より対応が遅れることがあります。予めご了承ください。 ご迷惑をおかけいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
目的: 日本人の食道がんにおけるゲノム変異を探索する
研究方法: 食道がん切除切片における非腫瘍組織 (正常組織) および腫瘍組織より抽出したDNAを使用したNGSライブラリーを作成後、Illumina HiSeq 2000/2500/X Fiveにて塩基配列を決定する。
対象: 食道がん患者の非腫瘍組織および腫瘍組織のDNA
データセット ID | アクセス制限 | データの種類 | 公開日 | |
|---|---|---|---|---|
| JGAD000233 | 制限公開(Type I) | NGS(WGS) | 2020-09-28 | |
| JGAD000405 | 制限公開(Type I) | NGS(WGS) | 2021-05-25 | |
研究プロジェクト名 | URL |
|---|---|
| データなし | |
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| データなし | ||
タイトル | DOI | データセット |
|---|---|---|
| データなし | ||
名前 | 所属機関 | 国 | 研究題目 | データ利用期間 | データセット一覧 |
|---|---|---|---|---|---|
| 白石航也 | National Cancer Center Research Institute | Japan | ゲノム解析に基づく宿主並びに腫瘍における免疫応答ネットワーク機構の解明 | 2019-08-05—2029-03-31 | |
| 山本雅之 | Tohoku University | Japan | 日本人全ゲノムデータベースの構築 | 2019-06-24—2022-04-15 | |