NBDC Research ID: hum0381.v1

 

研究内容の概要

目的: 血液、腫瘍組織標本を用いて、病理学的評価、薬物動態・分子イメージング解析、ゲノム解析、免疫モニタリングを行い、多角的な解析を行うことで、切除不能または再発胸腺がん患者における、ニボルマブの有効性と安全性に関するバイオマーカーの探索を行う。

方法: 末梢血血球成分を用いて、Immuno-PGxパネルによる免疫関連遺伝子(SNV、inDelの解析と機能予測、コピー数変異解析など)の解析を行う。

対象: NCCH1505試験へ参加している胸腺がん患者のうち、Immuno-pharmacogenomics(Immuno-PGx)を行った15症例

 

データID内容制限公開日
JGAS000588 NGS(Target Capture) 制限公開(Type I) 2023/01/05

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分子データ

JGAS000588

対象 胸腺がん(ICD10:C37):15症例
規模 Target Capture
対象領域(Target Captureの場合) Immuno-PGxパネル
Platform Illumina [NextSeq 500]
ライブラリソース 末梢血から抽出したDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) Sure Select XT Library Prep Kit
断片化の方法 超音波断片化 (Covaris)
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 101 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID JGAD000715
総データ量 17.1 GB(fasq)
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提供者情報

研究代表者: 堀之内 秀仁

所 属 機 関: 国立がん研究センター中央病院 呼吸器内科

プロジェクト/研究グループ名: -

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 胸腺癌、胸腺腫に対する抗PD-1抗体ニボルマブ適応拡大のための研究 JP17ck010616

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 Comprehensive biomarker analysis from phase II study of nivolumab in patients with thymic carcinoma doi: 10.3389/fonc.2022.966527 JGAD000715
2

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関国・州名研究題目利用データID利用期間