NBDC Research ID: hum0381.v1
研究内容の概要
目的: 血液、腫瘍組織標本を用いて、病理学的評価、薬物動態・分子イメージング解析、ゲノム解析、免疫モニタリングを行い、多角的な解析を行うことで、切除不能または再発胸腺がん患者における、ニボルマブの有効性と安全性に関するバイオマーカーの探索を行う。
方法: 末梢血血球成分を用いて、Immuno-PGxパネルによる免疫関連遺伝子(SNV、inDelの解析と機能予測、コピー数変異解析など)の解析を行う。
対象: NCCH1505試験へ参加している胸腺がん患者のうち、Immuno-pharmacogenomics(Immuno-PGx)を行った15症例
データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
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JGAS000588 | NGS(Target Capture) | 制限公開(Type I) | 2023/01/05 |
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分子データ
対象 | 胸腺がん(ICD10:C37):15症例 |
規模 | Target Capture |
対象領域(Target Captureの場合) | Immuno-PGxパネル |
Platform | Illumina [NextSeq 500] |
ライブラリソース | 末梢血から抽出したDNA |
検体情報(購入の場合) | - |
ライブラリ作製方法(キット名) | Sure Select XT Library Prep Kit |
断片化の方法 | 超音波断片化 (Covaris) |
ライブラリ構築方法 | Paired-end |
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) | 101 bp |
Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000715 |
総データ量 | 17.1 GB(fasq) |
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提供者情報
研究代表者: 堀之内 秀仁
所 属 機 関: 国立がん研究センター中央病院 呼吸器内科
プロジェクト/研究グループ名: -
科研費/助成金(Research Project Number):
科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
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日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 | 胸腺癌、胸腺腫に対する抗PD-1抗体ニボルマブ適応拡大のための研究 | JP17ck010616 |
関連論文
タイトル | DOI | データID | |
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1 | Comprehensive biomarker analysis from phase II study of nivolumab in patients with thymic carcinoma | doi: 10.3389/fonc.2022.966527 | JGAD000715 |
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制限公開データの利用者一覧
研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
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