NBDC Research ID: hum0262.v1
研究内容の概要
目的： 発現モジュール解析に基づいた肺腺癌における微小管阻害剤効果予測マーカーの探索
方法： RNAシークエンス
対象： 肺腺がん24症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000267 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2021/05/11 |
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分子データ
| 対象 | 肺腺がん（ICD10：C349）：24症例 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 1500/2500] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織（FFPE）から抽出したRNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | TruSeq RNA Access Library Prep Kit |
| 断片化の方法 | - |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 202 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000370 |
| 総データ量 | 751.7 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 土原 一哉
所 属 機 関： 国立がん研究センター 先端医療開発センター トランスレーショナルインフォマティクス分野
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業 | 進行肺がん大規模クリニカルシークエンスデータを用いた個別化治療法の開発 | JP19ck0106255 |
| 科学研究費助成事業 新学術領域研究（研究領域提案型） | 次世代トランスクリプトーム解析技術の開発と応用 | 17H06306 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
| 浜田 道昭 | 早稲田大学 理工学術院 | 日本 | RNA標的創薬データベースの構築 | JGAD000370 | 2022/12/26-2025/03/31 |
