NBDC Research ID: hum0128.v1
研究内容の概要
目的： 好酸球性副鼻腔炎の病態解析
方法： 慢性副鼻腔炎症例の鼻茸から抽出したRNAを用いたRNA-seq
対象： 好酸球性副鼻腔炎を含む慢性副鼻腔炎症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000153 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2018/10/29 |
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分子データ
| 対象 | 好酸球性副鼻腔炎を含む慢性副鼻腔炎（ICD10：J329）：6症例 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [HiSeq 2000] |
| ライブラリソース | 慢性副鼻腔炎症例の鼻茸（ポリープ）から抽出したRNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | TruSeq RNA Sample Prep Kit |
| 断片化の方法 | 高温条件下での2価陽イオンによる断片化 |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 100 bp x 2 |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000231 |
| 総データ量 | 20 MB (カウントデータ、txt） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 藤枝 重治
所 属 機 関： 福井大学医学部 耳鼻咽喉科・頭頸部外科学
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） 難治性疾患実用化研究事業 | 重症好酸球性副鼻腔炎に対する新しい治療戦略 | JP16ek0109062 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Periostin as a novel biomarker for postoperative recurrence of chronic rhinosinitis with nasal polyps | doi: 10.1038/s41598-018-29612-2 | JGAD000231 |
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制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
