hum0116 リリース情報

Research ID公開日内容
hum0116.v1 2020/11/20 NGS(Target Capture)

 

hum0116.v1

・急性骨髄性白血病患者19症例から採取した白血病幹細胞、Pre-白血病幹細胞、T細胞、B細胞、および、19症例のうち12症例の患者から作製した白血病ヒト化マウスから採取したヒト白血病細胞を用いたAML Cancer panel(NGS)データをfastqファイルにて提供する。KAPA Hyper Prep kitおよびxGen® Acute Myeloid Leukemia Cancer Panelにてライブラリー作成後、HiSeq 1500にて平均長50bpのDNA断片を解読した(Single-end)。

・急性骨髄性白血病106症例の患者末梢血もしくは骨髄液、患者検体を移植し白血病を発症したマウスの骨髄液もしくは脾臓細胞(全て白血病細胞)から抽出したDNAを用いたTarget Captureシークエンシング解析データをfastqファイルにて提供する。対象領域となる41遺伝子領域を7つに分けてデザインしたプライマーを用いたmultiplex PCRを行い、2nd PCRでそれぞれ異なるバーコードを付けてDNAライブラリー作成後poolし、HiSeq 2500にてpaired-endで解読した。

 

Note: