hum0009 リリース情報
Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0009.v3 | 2015/08/03 | NGS(PBAT-seq) |
hum0009.v2 | 2015/01/07 | CpGサイトのメチル化率情報 |
hum0009.v1 | 2014/12/24 | NGS(PBAT-seq) |
hum0009.v3
このバージョンでは、制限公開データ(Type I)として当初公開していたJGAD000006のアクセス制限(制限公開[Type I])を非制限公開データ(DRA003802)に変更し、公開を開始した。データのダウンロードはDRAから。
hum0009.v2
このバージョンでは、Bismark(v.0.9.0)のmethylation extractorを使用し、JGAD000006の各シトシンのメチル化率を算出。CpGサイトについては、両ストランドのリードを合わせてメチル化率を算出している。
hum0009.v1
このバージョンでは、卵子、精子、受精卵(着床前胚)、臍帯血細胞から抽出したゲノムDNAよりpost-bisulfite adaptor tagging(PBAT)法を用いたライブラリー調製を行ない、Illumina社 HiSeq 2000もしくは2500を用いて産出したゲノムワイドメチル化データを提供する(Single-end)。
Note: