hum0009 リリース情報

 

Research ID公開日内容
hum0009.v3 2015/08/03 NGS(PBAT-seq)
hum0009.v2 2015/01/07 CpGサイトのメチル化率情報
hum0009.v1 2014/12/24 NGS(PBAT-seq)

 

hum0009.v3

このバージョンでは、制限公開データ(Type I)として当初公開していたJGAD000006のアクセス制限(制限公開[Type I])を非制限公開データ(DRA003802)に変更し、公開を開始した。データのダウンロードはDRAから。

 

hum0009.v2

このバージョンでは、Bismark(v.0.9.0)のmethylation extractorを使用し、JGAD000006の各シトシンのメチル化率を算出。CpGサイトについては、両ストランドのリードを合わせてメチル化率を算出している。

 

hum0009.v1

このバージョンでは、卵子、精子、受精卵(着床前胚)、臍帯血細胞から抽出したゲノムDNAよりpost-bisulfite adaptor tagging(PBAT)法を用いたライブラリー調製を行ない、Illumina社 HiSeq 2000もしくは2500を用いて産出したゲノムワイドメチル化データを提供する(Single-end)。

 

 

Note: