hum0496 リリース情報
| Research ID | 公開日 | 内容 |
|---|---|---|
| hum0496.v2 | 2026/02/27 | SNP-chipを用いて決定したHondoクラスター、Ryukyuクラスターごとのアレルカウントおよびアレル頻度データ |
| hum0496.v1 | 2025/02/27 | 血清ALT値、AST値、GGT値のGWAS |
hum0496.v2
沖縄バイオインフォメーションバンク(OBi)に登録された一般集団のうち、PCA-UMAPに基づき分類されたHondoクラスターに属する1,420名、ならびに、Ryukyuクラスターに属する8,715名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析により決定した遺伝子型から算出したアレルカウントおよびアレル頻度データをtsv形式にて提供する。
hum0496.v1
沖縄バイオインフォメーションバンク(OBi)およびバイオバンク・ジャパン(BBJ)に登録された一般集団のうち、Ryukyuクラスターに属する8,715名(OBi)、ならびに、 7,004名(BBJ)の中で、血清ALT/AST/GGT値のデータが利用可能な者を解析対象とした。末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析による遺伝型決定後にImputationを実施し、各集団での血清ALT値、AST値、GGT値に対するゲノムワイド関連解析後にメタ解析を行ったデータをテキスト形式にて提供する。
Note: