hum0197 リリース情報

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Research ID公開日内容
hum0197.v21 2024/10/28 自己免疫疾患のゲノムワイド関連解析、自己免疫疾患のNGS(WGS)より算出した内在性ヘルペスウイルス6(eHHV-6)の有無およびアネロウイルス量、eHHV-6B陽性および陰性SLEのscRNA-seqデータ、縄文割合のゲノムワイド関連解析
hum0197.v20 2024/05/30 不育症のゲノムワイド関連解析
hum0197.v19 2024/05/29 2型糖尿病のGWASより算出した各バリアントの重みデータ
hum0197.v18 2023/10/02 腸内微生物叢、血中代謝物、KEGG Gene OrthologおよびKEGG Pathwayのゲノムワイド関連解析
hum0197.v17 2023/06/27 間質性膀胱炎ハンナ型のゲノムワイド関連解析
hum0197.v16 2023/06/06 15形質のゲノムワイド関連解析
hum0197.v15 2023/03/29 メタゲノム
hum0197.v14 2023/02/16 5形質のゲノムワイド関連解析
hum0197.v13 2023/02/14 scRNA-seqデータ、臨床情報
hum0197.v12 2022/12/01 微生物ゲノムのMAG、ウイルスのゲノム配列、CRISPR spacer配列
hum0197.v11 2022/07/21 scRNA-seqデータ
hum0197.v10 2022/06/16 9形質のゲノムワイド関連解析
hum0197.v9 2022/06/10 頭蓋内胚細胞腫瘍のゲノムワイド関連解析
hum0197.v8 2022/06/03 メタゲノム
hum0197.v7 2022/05/23 メタゲノム
hum0197.v6 2022/02/08 miRNAリードカウント、eQTL解析データ
hum0197.v5 2021/12/21 10形質のゲノムワイド関連解析、79形質のFine-mapping
hum0197.v4 2021/12/10 メタゲノム
hum0197.v3 2021/03/22 215形質のゲノムワイド関連解析
hum0197.v2 2020/11/27 肺胞蛋白症のゲノムワイド関連解析、メタゲノム
hum0197.v1 2019/11/15 メタゲノム

 

hum0197.v21

自己免疫疾患2,238症例、対照群2,919名を対象とした全ゲノムシーケンスから算出した内在性ヘルペスウイルス6(eHHV-6)の有無やアネロウイルス量データ(tsv)およびeHHV-6B陽性自己免疫疾患22症例と陰性216症例のゲノムワイド関連解析データ(tsv)およびeHHV-6B陽性SLE3症例と陰性SLE5症例のシングルセルRNAシーケンスデータ(fastq)ならびにバイオバンク・ジャパン171,287名における縄文割合を形質としたゲノムワイド関連解析データ(txt)を提供する。

 

hum0197.v20

不育症1,728症例および対照者24,315名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析によりgenotypeを決定し、Imputation後、GWASを実施した結果(統計情報)を提供する(txt)。

 

hum0197.v19

バイオバンク・ジャパン2型糖尿病症例27,642名と対照群70,242名、UKバイオバンクの2型糖尿病症例27,642名と対照群70,242名のゲノムワイド関連解析データを基に算出した、ポリジェニックスコア予測対象である東北メディカル・メガバンクおよびバイオバンク・ジャパン2次コホートに存在する多型の重みデータを提供する(txt)。

 

hum0197.v18

日本人集団524名の末梢血から抽出したDNAを用いた腸内微生物叢のゲノムワイド関連解析データ、日本人集団362名の末梢血から抽出したDNAを用いた血中代謝物のゲノムワイド関連解析データ、日本人集団524名の末梢血から抽出したDNAを用いたKEGG Gene OrthologおよびKEGG Pathwayのゲノムワイド関連解析データを提供する(txt)。

 

hum0197.v17

間質性膀胱炎ハンナ型144症例および健常者41,516名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析によりgenotypeを決定し、Imputation後、GWASを実施した結果(統計情報)を提供する(txt)。

 

hum0197.v16

バイオバンク・ジャパン180,215名およびUKバイオバンク377,441名の末梢血から抽出したDNAを用いた、15形質のゲノムワイド関連解析データ、ならびに、FinnGen、Breast Cancer Association Consortium(BCAC)、Prostate Cancer Association Group to Investigate Cancer Associated Alterations in the Genome(PRACTICAL)の要約統計量を含めたメタ解析(乳がん:648,746名、前立腺がん:482,080名)データを提供する(txt)。

 

hum0197.v15

下記のメタゲノム関連解析データを提供する(fastq)。

・日本人88名の便より抽出したDNAを用いた、ショットガンシークエンスデータ。

・健常者73名の便より抽出したDNA(フェノール・クロロホルム法+DNeasy PowerSoil Pro Kit)を用いた、ショットガンシークエンスデータ。

・日本人5名の便より抽出したDNAを用いた、高深度ショットガンシークエンスデータ。

 

hum0197.v14

日本人集団および多人種集団(バイオバンク・ジャパン:179,000名、UKバイオバンク:361,000名、FinnGen:136,000名)の末梢血から抽出したDNAを用いた、5形質のゲノムワイド関連解析データを提供する(txt)。

 

hum0197.v13

日本人集団におけるCOVID-19患者43症例と健常者44名の末梢血単核細胞(PBMC)から抽出したRNAを用いたscRNA-seq解析データ(fastq)、およびhum0019.v11とhum0197.v13の臨床情報(xlsx)を提供する。

 

hum0197.v12

hum0197.v7およびhum0197.v8のメタゲノム関連解析に関連して得られた日本人腸内微生物のMAG・ウイルスのゲノム配列・CRISPR spacer配列を提供する(fasta)。

 

hum0197.v11

日本人集団におけるCOVID-19患者30症例と健常者31名の末梢血単核細胞(PBMC)から抽出したRNAを用いたscRNA-seq解析データを提供する(fastq)。

 

hum0197.v10

バイオバンク・ジャパン161,801名およびUKバイオバンク377,583名の末梢血から抽出したDNAを用いた、9形質のゲノムワイド関連解析データを提供する(txt)。

 

hum0197.v9

頭蓋内胚細胞腫瘍133症例および健常者762名の末梢血から抽出したDNAを用いたSNPアレイ解析によりgenotypeを決定し、Imputation後、GWASを実施した結果(統計情報)を提供する(txt)。

 

hum0197.v8

日本人集団136名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する(fastq)。

 

hum0197.v7

潰瘍性大腸炎35症例、クローン病39症例、対照健常者40名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する(fastq)。

 

hum0197.v6

日本人集団141名の全血および末梢血単核球(PBMC)を分取し、全血から抽出したgenomic DNAを用いた全ゲノムシーケンス、PBMCから抽出したRNAを用いたsmall RNA-seqを実施した。個人毎のmiRNAリードカウントデータおよびeQTLサマリーデータを提供する(txt)。

 

hum0197.v5

日本人集団(バイオバンク・ジャパン:179,000名)の末梢血から抽出したDNAを用いた、10形質のゲノムワイド関連解析データおよび79形質のFine-mappingデータを提供する(txt)。

 

hum0197.v4

日本人集団227+30名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する(fastq)。

 

hum0197.v3

日本人集団および多人種集団(バイオバンク・ジャパン:179,000名、UKバイオバンク:361,000名、FinnGen:136,000名)の末梢血から抽出したDNAを用いた、215形質のゲノムワイド関連解析データを提供する(txt)。

 

hum0197.v2

・肺胞蛋白症198症例および対照者395名の末梢血から抽出したDNAを用いてSNPアレイによりgenotypeを決定、Imputation後、GWASを実施した結果(統計情報)を提供する(txt)。

・日本人集団103名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する(fastq)。

 

hum0197.v1

日本人集団95名の便より抽出したDNAを用いた、全ゲノムショットガンシークエンスによるメタゲノム関連解析データを提供する(fastq)。

 

Note: