hum0111　リリース情報

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hum0111.v1

びまん性胃がん30症例の腫瘍組織から抽出したRNAを用いたRNA-seq、および、腫瘍組織と非腫瘍組織から抽出したRNAを用いたAmplicon-seqの結果を、テキストフィル（cuffnormの出力）およびfastqファイルにて提供する。TruSeq Stranded mRNA Sample Prep KitによるRNAライブラリ作製後、HiSeq 2000（Illumina）にて平均長100 bp x 2を読み（Paired-end）FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped fragments）値を算出した。一方、Amplicon-seqでは、PCRによりライブラリ作製後、MiSeq（Illumina）にて平均長300 bp x 2を読んだ（Paired-end）。

Note：