hum0099 リリース情報
| Research ID | 公開日 | 内容 |
|---|---|---|
| hum0099.v1 | 2017/04/24 |
RNA-seqによる遺伝子発現量データ（FPKM情報） eQTL解析の結果：各varinatの対象遺伝子に対する統計量（effect size、 P-value等）のまとめ |
hum0099.v1
健常者105名（男性21名、女性84名）の末梢血単核細胞から5種類の免疫細胞（CD4陽性T細胞、CD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、単球）を単離し、各細胞からtotal RNAを抽出した。また、全血からDNAとtotal RNAを抽出した。
DNAに対しては、Infinium OmniExpressExome BeadChips（Illumina）を用いたgenotypingを実施し、total RNAに対しては、TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kits（Illumina）を用いてRNA-seqのライブラリーを作成後、HiSeq 2500により平均長125bpを読んだ（paired-end）。
RNA-seqの結果は制限公開データとして個別検体の遺伝子毎の発現量をFPKM値として提供する（txt）。また、SNPアレイ情報については非制限公開データとして統計解析結果を提供する（txt）。
Note：
