hum0068 リリース情報

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Research ID公開日内容
hum0068.v4 2022/03/23 NGS(scDNA-seq、RNA-seq)
hum0068.v3 2021/12/14 NGS(RNA-seq、WGS)
hum0068.v2 2020/10/19 NGS(WGS)
hum0068.v1 2017/07/10 NGS(PCR amplicon Seq)

 

hum0068.v4

肺腺がん2症例の腫瘍組織から単離した細胞から抽出したDNAを対象としたsingle cellのWGS解析結果をfastqファイルにて提供する。Chromium Single Cell DNA Reagent Kits にてライブラリを作製し、NovaSeqを用いてシークエンスを行った。

肺腺がん5症例の腫瘍組織から抽出したRNAを対象としたRNA-seq解析の結果をfastqファイルにて提供する。SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kitにてライブラリを作製し、NovaSeqを用いてシークエンスを行った。

 

hum0068.v3

肺腺がん11症例の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したRNA/DNAを対象としたRNA-seq解析ならびにWGS解析の結果をfastqファイルにて提供する。SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA KitおよびSQK-LSK109にてライブラリを作製し、NovaSeqおよびナノポアシークエンサーPromethIONを用いてシークエンスを行った。

 

hum0068.v2

肺腺がん21症例の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNAを対象としたWGS解析の結果をfastqファイルにて提供する。TruSeq Nano DNA Library Prep kitおよびSQK-LSK109にてライブラリを作製し、NovaSeqおよびナノポアシークエンサーPromethIONを用いてシークエンスを行った。

 

hum0068.v1

肺腺がん8症例の腫瘍組織から抽出したRNAを対象とし、逆転写反応の後にPCRによって目的領域を増幅した。Nanopore Sequencing Kitにてライブラリを作製し、MinION(Oxford Nanopore Technologies社)を用いたシークエンスの結果をFastqファイルにて提供する。

 

Note: