hum0014 リリース情報
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Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0014.v3 | 2016/01/28 | 2型糖尿病9817症例と対照者6763名および2型糖尿病5646症例と対照者19,420名のゲノムワイド関連解析 |
hum0014.v2 | 2015/12/28 | 健常者934名、35疾患各約190症例、食道がん182症例、筋萎縮性側索硬化症92症例の遺伝子型カウント情報 (JSNPのGenotype頻度データとして提供していた情報と同じものです) |
hum0014.v1 | 2014/09/30 | 心筋梗塞1666症例と対照健常者3198名のゲノムワイド関連解析 |
hum0014.v3
2型糖尿病9817症例と対照者6763名(552,915 SNPs)および2型糖尿病5646症例と対照者19,420名(479,088 SNPs)の遺伝子型カウント情報およびGWASの結果を追加した。
遺伝子型決定には、Illumina [OmniExpressExome BeadchipもしくはHuman610-Quad BeadChip]を使用している。
hum0014.v2
JSNP DATABASEにおいてGenotype頻度データとして公開されていた
健常者934名、35疾患各約190症例、食道がん182症例、筋萎縮性側索硬化症92症例の遺伝子型カウント情報を追加した。
35疾患は以下の通り。
悪性腫瘍 (肺がん、乳がん、胃がん、大腸・直腸がん、前立腺がん)
心血管系疾患 (心不全、心筋梗塞,不安定狭心症、安定狭心症、不整脈、閉塞性動脈硬化症)
脳血管障害 (脳梗塞、脳動脈瘤)
呼吸器疾患 (間質性肺炎&肺線維症、肺気腫、気管支喘息)
慢性肝疾患 (C型慢性肝炎、肝硬変)
眼疾患 (白内障、緑内障)
その他 (てんかん、歯周病、尿路結石、ネフローゼ症候群、子宮筋腫、子宮内膜症、骨粗鬆症、関節リウマチ、筋萎縮性側索硬化症、花粉症、アトピー性皮膚炎、過敏性症候群(薬疹)、高脂血症、糖尿病、バセドウ病)
遺伝子型決定には、Illumina [Human610-Quad BeadChip、HumanHap550v3 Genotyping BeadChip] 、Perlegen Sciences [high-density oligonucleotide arrays] およびHologic Japan [Invader]を使用している。
hum0014.v1
日本人心筋梗塞1666症例、および日本人対照健常者3198名の約45万6千SNPsの遺伝子型カウント情報およびGWASの結果を提供する。
遺伝子型決定には、Illumina [Human610-Quad BeadChipもしくはHumanHap550v3 Genotyping BeadChip]を使用している。
Note: