hum0006　リリース情報

hum0006.v5

このバージョンでは、脳海綿状血管奇形12症例、椎体血管腫1症例、眼窩内海綿状血管奇形3症例の病変組織および末梢血より抽出したDNAを用いた6110遺伝子領域のTarget Capture Sequencing解析の結果をfastqファイルにて提供する。

hum0006.v4

このバージョンでは、グリオーマ94症例（114検体）を対象とした以下の解析結果を追加した（JGAS000146）。

・ Exome（JGAD000215、JGAD000218）： グリオーマ：12症例（腫瘍組織：25検体、非腫瘍組織：12検体）

    腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。

・ RNA-seq（JGAD000216、JGAD000219）： グリオーマ：23症例（31検体）

    腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。

・ Methylation array（JGAD000217）： グリオーマ：93症例（113検体）

    腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

hum0006.v3

このバージョンでは、グリオーマ（小脳17症例、視床14症例、大脳8症例）を対象とした以下の解析結果を追加した（JGAS000106）。

・ Exome： 小脳グリオーマ：17症例（34検体）

    腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。

・ RNA-seq： 小脳グリオーマ17症例（17検体）および大脳グリオーマ8症例（8検体）

    腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。

・ Methylation array： 小脳グリオーマ17症例（17検体）および視床グリオーマ14症例（14検体）

    腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

hum0006.v2

このバージョンでは、オリゴデンドログリオーマ16症例を対象とした以下の解析結果をJGAS000004に追加した。

・ Exome： 48検体

    腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。

・ RNA-seq： 27検体

    腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）

・ Methylation array： 30検体

    腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

hum0006.v1

このバージョンでは、アストロサイトーマ6症例の初発時・再発時の腫瘍組織および末梢血（非腫瘍組織）から抽出したDNAを用いたExome解析の結果をbamファイルにて提供する。SureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した（Paired-end）。

Note：