hum0160 リリース情報

Research ID公開日内容
hum0160.v2 2021/07/13 NGS(WGS)のbam/gvcfデータ
hum0160.v1 2019/05/28 NGS(WGS)

 

hum0160.v2

JGAD000233に含まれるwhole genome sequencing解析データに対し、GEnome Medical alliance Japan(GEM Japan, GEM-J)の取り組みとして、GATK Best Practicesに準拠した方法により、GRCh37の参照ゲノム配列へのマッピングおよびバリアント検知を実施した際のbam/gvcfデータを追加した。

 

hum0160.v1

食道がん切除切片の非腫瘍組織(正常組織)および腫瘍組織から抽出したDNAを使用したWGS解析の結果(HiSeq 2000/2500/X Five)をFastqファイルで提供する(Paired-end)。

 

Note: