hum0017.v1 リリース情報
Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0017.v1 | 2016/02/22 | NGS(ExomeおよびRNA-seq) |
hum0017.v1
このバージョンでは、脳外科手術によって摘出されたPCNSL試料と、同一患者より得られた末梢血単核球のペアから抽出したゲノムDNAおよびPCNSL試料から抽出したRNAを対象とし、以下の解析を行った。
• Exome(41症例)
SureSelect ver. 5(Agilent)によりエクソン領域を絞り込み、HiSeq 2000(Illumina)のPaired-end modeにより両端100-105塩基の配列を決定、bam file形式にて提供する。
• RNA-seq(30症例)
NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、HiSeq 2000(Illumina)のPaired-end modeにより平均長100塩基を解読した(fastq file形式にて提供)。
Note: