hum0017.v1 リリース情報

Research ID公開日内容
hum0017.v1 2016/02/22 NGS(ExomeおよびRNA-seq)

 

hum0017.v1

このバージョンでは、脳外科手術によって摘出されたPCNSL試料と、同一患者より得られた末梢血単核球のペアから抽出したゲノムDNAおよびPCNSL試料から抽出したRNAを対象とし、以下の解析を行った。

 

• Exome(41症例)

SureSelect ver. 5(Agilent)によりエクソン領域を絞り込み、HiSeq 2000(Illumina)のPaired-end modeにより両端100-105塩基の配列を決定、bam file形式にて提供する。

 

• RNA-seq(30症例)

NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、HiSeq 2000(Illumina)のPaired-end modeにより平均長100塩基を解読した(fastq file形式にて提供)。

 

Note: