hum0006 リリース情報
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Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0006.v3 | 2017/09/01 | NGS (Exome、RNA-seq)、Methylation array |
hum0006.v2 | 2017/06/05 | NGS (Exome、RNA-seq)、Methylation array |
hum0006.v1 | 2014/01/31 | NGS (Exome) |
hum0006.v3
このバージョンでは、グリオーマ(小脳17症例、視床14症例、大脳8症例)を対象とした以下の解析結果を追加した(JGAS000106)。
・ Exome: 小脳グリオーマ:17症例(34検体)
腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。
・ RNA-seq: 小脳グリオーマ17症例(17検体)および大脳グリオーマ8症例(8検体)
腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。
・ Methylation array: 小脳グリオーマ17症例(17検体)および視床グリオーマ14症例(14検体)
腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
hum0006.v2
このバージョンでは、オリゴデンドログリオーマ16症例を対象とした以下の解析結果をJGAS000004に追加した。
・ Exome: 48検体
腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。
・ RNA-seq: 27検体
腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)
・ Methylation array: 30検体
腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。
hum0006.v1
このバージョンでは、アストロサイトーマ6症例の初発時・再発時の腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを用いたExome解析の結果をbamファイルにて提供する。SureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。
Note: