hum0005 リリース情報

 

Research ID公開日内容
hum0005.v8 2023/10/02 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、63遺伝子領域)
hum0005.v7 2021/11/19 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、63遺伝子領域、90遺伝子領域)
hum0005.v6 2021/07/30 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、63遺伝子領域、90遺伝子領域)
hum0005.v5 2019/04/18 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、90遺伝子領域)
hum0005.v4 2018/02/13 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、90遺伝子領域)
hum0005.v3 2017/06/19 NGS(Target Capture:69遺伝子領域)
hum0005.v2 2017/02/24 NGS(Target Capture:69遺伝子領域)
hum0005.v1 2014/01/27 NGS(Target Capture:9遺伝子領域)

 

hum0005.v8(JGAS000490)

このバージョンでは、非症候群性難聴1410症例の69遺伝子領域(354 kb)および1559症例の63遺伝子領域(295 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom PanelおよびIon AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

hum0005.v7(JGAS000323)

このバージョンでは、非症候群性難聴3症例の69遺伝子領域(354 kb)、11症例の63遺伝子領域(295 kb)、および1症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton/IonS5]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。

 

hum0005.v6(JGAS000191、JGAS000192、JGAS000200、JGAS000201)

このバージョンでは、非症候群性難聴17症例(JGAS000191:1症例、JGAS000192:9症例、JGAS000201:7症例)の69遺伝子領域(354 kb)、39症例(JGAS000192:17症例、JGAS000200:7症例、JGAS000201:15症例)の63遺伝子領域(295 kb)、および6症例(JGAS000192:2症例、JGAS000201:4症例)の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。

 

hum0005.v5(JGAS000166)

このバージョンでは、非症候群性難聴37症例の69遺伝子領域(354 kb)および2症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。

 

hum0005.v4(JGAS000123)

このバージョンでは、非症候群性難聴16症例の69遺伝子領域(354 kb)および3症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。

 

hum0005.v3(JGAS000093)

このバージョンでは、非症候群性難聴19症例の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

hum0005.v2(JGAS000032 および DRA003791)

このバージョンでは、非症候群性難聴44症例(JGAS000032:39症例、DRA003791:5症例)の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

hum0005.v1(DRA001273)

このバージョンでは、症候群性難聴(Usher症候群)17症例の9遺伝子領域(109 kb)のシーケンスデータfastqファイルを提供する。Ion AmpliSeq Custom kitを用いて領域をしぼり、Thermo Fisher Scientific [Ion PGM]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

Note: