hum0005 リリース情報
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Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0005.v6 | 2021/07/30 | NGS(Target Capture:69遺伝子領域、63遺伝子領域、90遺伝子領域) |
hum0005.v5 | 2019/04/18 | NGS(Target Capture:69遺伝子領域、90遺伝子領域) |
hum0005.v4 | 2018/02/13 | NGS(Target Capture:69遺伝子領域、90遺伝子領域) |
hum0005.v3 | 2017/06/19 | NGS(Target Capture:69遺伝子領域) |
hum0005.v2 | 2017/02/24 | NGS(Target Capture:69遺伝子領域) |
hum0005.v1 | 2014/01/27 | NGS(Target Capture:9遺伝子領域) |
hum0005.v6 (JGAS000191、JGAS000192、JGAS000200、JGAS000201)
このバージョンでは、非症候群性難聴17症例(JGAS000191:1症例、JGAS000192:9症例、JGAS000201:7症例)の69遺伝子領域(354 kb)、39症例(JGAS000192:17症例、JGAS000200:7症例、JGAS000201:15症例)の63遺伝子領域(295 kb)、および6症例(JGAS000192:2症例、JGAS000201:4症例)の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Life technologies [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005.v5 (JGAS000166)
このバージョンでは、非症候群性難聴37症例の69遺伝子領域(354 kb)および2症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Life technologies [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005.v4 (JGAS000123)
このバージョンでは、非症候群性難聴16症例の69遺伝子領域(354 kb)および3症例の90遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Life technologies [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。
hum0005.v3 (JGAS000093)
このバージョンでは、非症候群性難聴19症例の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Life technologies [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。
hum0005.v2 (JGAS000032 および DRA003791)
このバージョンでは、非症候群性難聴44症例(JGAS000032:39症例、DRA003791:5症例)の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Life technologies [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。
hum0005.v1(DRA001273)
このバージョンでは、症候群性難聴(Usher症候群)17症例の9遺伝子領域(109 kb)のシーケンスデータfastqファイルを提供する。Ion AmpliSeq Custom kitを用いて領域をしぼり、Life technologies [Ion PGM]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。
Note: