hum0005 リリース情報

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Research ID公開日内容
hum0005.v5 2019/04/18 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、89遺伝子領域)
hum0005.v4 2018/02/13 NGS(Target Capture:69遺伝子領域、89遺伝子領域)
hum0005.v3 2017/06/19 NGS(Target Capture:69遺伝子領域)
hum0005.v2 2017/02/24 NGS(Target Capture:69遺伝子領域)
hum0005.v1 2014/01/27 NGS(Target Capture:  9遺伝子領域)

 

hum0005.v5 (JGAS000166)

このバージョンでは、非症候群性難聴37症例の69遺伝子領域(354 kb)および2症例の89遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Life technologies [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。

 

hum0005.v4 (JGAS000123)

このバージョンでは、非症候群性難聴16症例の69遺伝子領域(354 kb)および3症例の89遺伝子領域(568 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0、およびAgilent Sure Select XTを用いてターゲット領域にしぼり、Life technologies [Ion PGM/Ion Proton]またはIllumina [HiSeq 2000]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp、Paired-end: 100 bp)。

 

hum0005.v3 (JGAS000093)

このバージョンでは、非症候群性難聴19症例の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Life technologies [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

hum0005.v2 (JGAS000032 および DRA003791)

このバージョンでは、非症候群性難聴44症例(JGAS000032:39症例、DRA003791:5症例)の69遺伝子領域(354 kb)のシーケンスデータが追加された(fastqファイル)。追加データについては、Ion AmpliSeq Custom Panel、Ion AmpliSeq Library Kit ver 2.0を用いて領域をしぼり、Life technologies [Ion PGM]または[Ion Proton]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

hum0005.v1(DRA001273)

このバージョンでは、症候群性難聴(Usher症候群)17症例の9遺伝子領域(109 kb)のシーケンスデータfastqファイルを提供する。Ion AmpliSeq Custom kitを用いて領域をしぼり、Life technologies [Ion PGM]にて配列を読んでいる(Single-end: 200 bp)。

 

Note: