hum0158 リリース情報
Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0158.v3 | 2021/07/13 | NGS(WGS)のbam/gvcfデータ |
hum0158.v2 | 2019/06/21 | NGS(WGS) |
hum0158.v1 | 2018/10/22 | NGS(WGS、RNA-seq) |
hum0158.v3
JGAD000228に含まれるwhole genome sequencing解析データに対し、GEnome Medical alliance Japan(GEM Japan, GEM-J)の取り組みとして、GATK Best Practicesに準拠した方法により、GRCh37の参照ゲノム配列へのマッピングおよびバリアント検知を実施した際のbam/gvcfデータを追加した。
hum0158.v2
肝臓がん5症例のWGSデータ(Fastq・20ファイル)を追加した。
hum0158.v1
肝臓がん切除切片における腫瘍組織および非腫瘍組織または末梢血から抽出したDNAおよびRNAを使用したWGS解析、および、RNA-seq解析の結果(HiSeq または Genome Analyzer)をFastqファイルで提供する(Paired-end)。
Note: