hum0103 リリース情報
Research ID | 公開日 | 内容 |
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hum0103.v4 | 2022/01/18 | NGS(WGS、Exome、RNA-seq) |
hum0103.v3 | 2021/07/13 | NGS(WGS)のbam/gvcfデータ |
hum0103.v2 | 2019/06/21 | NGS(WGS) |
hum0103.v1 | 2018/02/27 | NGS(WGS、Exome) |
hum0103.v4
胆道がん43症例の腫瘍組織および非腫瘍組織から抽出したDNAを用いたWGS解析データならびにExome解析データ、胆道がん100症例の腫瘍組織および正常胆嚢(4名)の正常組織より抽出したRNAを用いたRNA-seq解析データをFastqファイルで提供する。
hum0103.v3
JGAD000117に含まれるwhole genome sequencing解析データに対し、GEnome Medical alliance Japan(GEM Japan, GEM-J)の取り組みとして、GATK Best Practicesに準拠した方法により、GRCh37の参照ゲノム配列へのマッピングおよびバリアント検知を実施した際のbam/gvcfデータを追加した。
hum0103.v2
胆道がん3症例のWGSデータ(Fastq・14ファイル)を追加した。
hum0103.v1
胆道がん切除切片の非腫瘍組織(正常組織)および腫瘍組織から抽出したDNAを使用したWGS解析、および、Exome解析の結果(HiSeq 2000/2500)をFastqファイルで提供する(Paired-end)。
Note: