対象データセット

JGAデータセット研究タイトルサンプル数データ加工日備考
JGAD000252 ゲノム解析に基づく肺がんの発生・進展の分子機構の解明(hum0068) 21 Per-sample:2021-12-27
QC:2022-01-06
Joint-call:2022-01-26

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体(matched control)ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体(Germline)を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID:JGAD000670

JGAD000235 シークエンス解析によるがんゲノム研究:大腸がん(hum0159) 10 Per-sample:2021-12-27
QC:2022-01-06
Joint-call:2022-01-31

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体(matched control)ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体(Germline)を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID:JGAD000689

JGAD000234 シークエンス解析によるがんゲノム研究:肝芽腫(hum0161) 33 Per-sample:2021-12-27
QC:2022-01-06
Joint-call:2022-01-31

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体(matched control)ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体(Germline)を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID:JGAD000688

JGAD000335

ヒト腫瘍試料の収集・分譲とゲノム情報を利用した研究

既存試料の分譲とゲノム情報を利用した研究

消化器慢性炎症性疾患における遺伝子変異の検索(hum0201)

14 Per-sample:2021-12-27
QC:2022-01-06
Joint-call:2022-01-06

腫瘍組織由来の検体と非腫瘍組織由来の検体(matched control)ペアの全ゲノムシークエンス解析データ。非腫瘍組織由来検体(Germline)を対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID:JGAD000687

JGAD000220 オーダーメイド医療の実現プログラム(hum0014) 1,026 Per-sample:2022-01-16
QC:2022-02-24

2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録された 1,026名の全ゲノムシークエンス解析データを対象にデータ加工を実施した。

加工データのDataset ID:JGAD000690

JGAD000220 オーダーメイド医療の実現プログラム(hum0014) 1,026 Joint-call:
2023-01-30 (autosome and chrX PAR regions; BOTHSEX)、
2023-02-25 (chrX non-PAR regions; FEMALE samples)、
2023-03-02 (chrXY non-PAR regions; MALE samples)

2003年から2007年度にバイオバンク・ジャパンに登録された 1,026名の全ゲノムシークエンス解析データを対象にデータ加工を実施した。Genotypeコールの際、Joint callを実施した。

加工データのDataset ID:JGAD000758

※加工データの利用にあたっては、元データ(表の一番左側に表示されているDataset)のデータ利用申請を実施いただく必要がある。データ利用申請方法はこちら