2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所(NIG)バイオデータ研究拠点(BSI)ライフサイエンス統合データベース部門(DBCLS)」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
- 公開日
- 2026-02-05
- 更新日
- 2026-02-05
- 研究
- hum0551
- データの種類
- アレルギー感作のGWAS統計量のメタ解析
- アクセス制限
- 非制限公開
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
日本人一般集団43,834名(アレルギー感作20,492名、対照23,342名) 日本人一般集団43,834名(アレルギー感作20,492名、対照23,342名)とヨーロッパ人一般集団25,032名(アレルギー感作8,246名、対照16,786名) 日本人一般集団21,932名(アレルギー多感作4,923名、対照17,009名)
- 実験方法
genome wide SNPs
- プラットフォーム
Illumina [Infinium Asian Screening Array] Thermo Fisher Scientific [Axiom Japonica Array v2]
- 試料説明
末梢血から抽出したDNA
- 試薬
Axiome Japonica array version 2、Infinium™ Asian Screening Array-24 v1.0
- 解析方法
遺伝子型決定: GenomeStudio ハプロタイプフェージング: Shapeit2 インピュテーション: Minimac4
- フィルタリング
日本人: Rsq > 0.7
- バリアント数
日本人: 5,189,598 日本人とヨーロッパ人: 4,589,330 多感作: 5,049,687
- NBDCデータセットAccession
hum0551.v1.gwas.v1 (データのダウンロードは上記Dataset IDをクリックしてください) Dictionary file
- 総データ量
1.5 GB(txt)
- 利用ポリシー
