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NBDC ヒトデータベース
hum0197.v12.VIRUS.v1
公開日
2022-12-01

更新日
2026-07-31

研究
hum0197

データの種類
微生物ゲノムのMAG・ウイルスのゲノム配列・CRISPR spacer配列

アクセス制限
非制限公開

解析手法

NGS (WGS)

材料と対象者

日本人腸内微生物ゲノム JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531、公開データ (DRA006684) より取得

実験方法

NGS (WGS)

プラットフォーム

Illumina [HiSeq 2500/3000、NovaSeq 6000]

ウイルスゲノム構築

metaspadesによるde novo assemblyの後に、virfinder及びvirsorterによってウイルスゲノムを検出。

Sequence Read Archive Accession

JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531: BRDB01000001-BRDB01028816 DRA006684: EMNW01000001-EMNW01002579

総データ量

JGAS000205/JGAS000260/JGAS000316/JGAS000415/JGAS000530/JGAS000531: 1.09 GB (fasta) DRA006684: 98.3 MB (fasta)

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