2026年4月1日付の組織体制変更により、当部門は「データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター」から、「国立遺伝学研究所（NIG）バイオデータ研究拠点（BSI）ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）」となりました。ガイドラインにおいて旧名称が残っております箇所につきましては、すべて新名称に読み替えて適用くださいますようお願いいたします
現在、多数のデータ提供申請をいただいており、確認作業に通常よりも時間を要しております。お待たせして大変申し訳ございませんが、何卒ご理解いただけますようお願い申し上げます。申請いただく際は、お時間に余裕を持ってお手続きいただけますと幸いです
- 公開日
- 2015-12-28
- 更新日
- 2024-10-25
- 研究
- hum0014
- データの種類
- 35疾患各約190症例における遺伝子型カウント情報 (JSNPのデータ)
- アクセス制限
- 非制限公開
解析手法
Genotyping by array
- 材料と対象者
悪性腫瘍 (肺がん、乳がん、胃がん、大腸・直腸がん、前立腺がん) 心血管系疾患 (心不全、心筋梗塞，不安定狭心症、安定狭心症、不整脈、閉塞性動脈硬化症) 脳血管障害 (脳梗塞、脳動脈瘤) 呼吸器疾患 (間質性肺炎＆肺線維症、肺気腫、気管支喘息) 慢性肝疾患 (C型慢性肝炎、肝硬変) 眼疾患 (白内障、緑内障) その他 (てんかん、歯周病、尿路結石、ネフローゼ症候群、子宮筋腫、子宮内膜症、 骨粗鬆症、関節リウマチ、筋萎縮性側索硬化症、花粉症、アトピー性皮膚炎、 過敏性症候群(薬疹)、高脂血症、糖尿病、バセドウ病) 各約190症例
- 実験方法
genome wide SNVs
- プラットフォーム
Perlegen Sciences [high-density oligonucleotide arrays]
- 試料説明
末梢血から抽出したgDNA
- バリアント数
約20万SNPs (b129)
- NBDCデータセットAccession
悪性腫瘍 (肺がん、乳がん、胃がん、大腸・直腸がん、前立腺がん) 心血管系疾患 (心不全、心筋梗塞、不安定狭心症、安定狭心症、不整脈、閉塞性動脈硬化症) 脳血管障害 (脳梗塞、脳動脈瘤) 呼吸器疾患 (間質性肺炎＆肺線維症、肺気腫、気管支喘息) 慢性肝疾患 (C型慢性肝炎、肝硬変) 眼疾患 (白内障、緑内障) その他 (てんかん、歯周病、尿路結石、ネフローゼ症候群、子宮筋腫、子宮内膜症、 骨粗鬆症、関節リウマチ、筋萎縮性側索硬化症、花粉症、アトピー性皮膚炎、 過敏性症候群(薬疹)、高脂血症、糖尿病、バセドウ病) (データのダウンロードは上記疾患名をクリックしてください) Dictionary file
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