NBDC Research ID: hum0381.v1
研究内容の概要
目的： 血液、腫瘍組織標本を用いて、病理学的評価、薬物動態・分子イメージング解析、ゲノム解析、免疫モニタリングを行い、多角的な解析を行うことで、切除不能または再発胸腺がん患者における、ニボルマブの有効性と安全性に関するバイオマーカーの探索を行う。
方法： 末梢血血球成分を用いて、Immuno-PGxパネルによる免疫関連遺伝子（SNV、inDelの解析と機能予測、コピー数変異解析など）の解析を行う。
対象： NCCH1505試験へ参加している胸腺がん患者のうち、Immuno-pharmacogenomics（Immuno-PGx）を行った15症例
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000588 | NGS（Target Capture） | 制限公開（Type I） | 2023/01/05 |
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分子データ
| 対象 | 胸腺がん（ICD10：C37）：15症例 |
| 規模 | Target Capture |
| 対象領域（Target Captureの場合） | Immuno-PGxパネル |
| Platform | Illumina [NextSeq 500] |
| ライブラリソース | 末梢血から抽出したDNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | Sure Select XT Library Prep Kit |
| 断片化の方法 | 超音波断片化 （Covaris） |
| ライブラリ構築方法 | Paired-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 101 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | JGAD000715 |
| 総データ量 | 17.1 GB（fasq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy |
提供者情報
研究代表者： 堀之内 秀仁
所 属 機 関： 国立がん研究センター中央病院 呼吸器内科
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 日本医療研究開発機構（AMED） 革新的がん医療実用化研究事業 | 胸腺癌、胸腺腫に対する抗PD-1抗体ニボルマブ適応拡大のための研究 | JP17ck010616 |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | Comprehensive biomarker analysis from phase II study of nivolumab in patients with thymic carcinoma | doi: 10.3389/fonc.2022.966527 | JGAD000715 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
