NBDC Research ID: hum0148.v1
研究内容の概要
目的： 腎細胞がんの診断および治療標的遺伝子の探索
方法： 腫瘍組織から抽出したRNAを用いたRNAseqによる網羅的遺伝子発現解析
対象： がん研究会有明病院の腎がん患者由来の原発巣（43症例）並びに転移巣（24症例）の腫瘍組織
| データID | 内容 | 制限 | 公開日 |
|---|---|---|---|
| JGAS000149 | NGS（RNA-seq） | 制限公開（Type I） | 2019/06/20 |
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分子データ
| 対象 |
腎がん（ICD10：C64）：67症例 原発巣：43症例 転移巣：24症例 |
| 規模 | RNA-seq |
| 対象領域（Target Captureの場合） | - |
| Platform | Illumina [Genome Analyzer IIx] |
| ライブラリソース | 腫瘍組織から抽出したRNA |
| 検体情報（購入の場合） | - |
| ライブラリ作製方法（キット名） | TruSeq RNA Sample Prep Kit v2 |
| 断片化の方法 | 熱処理 |
| ライブラリ構築方法 | Single-end |
| リード長（除：バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー） | 51 bp |
| Japanese Genotype-phenotype Archive Dataset ID | |
| 総データ量 | 67 GB（fastq） |
| コメント（利用にあたっての制限事項） | NBDC policy および Cancer Research Use Only |
提供者情報
研究代表者： 湯浅 健
所 属 機 関： がん研究会有明病院・泌尿器科
プロジェクト/研究グループ名： -
科研費/助成金（Research Project Number）：
| 科研費・助成金名 | タイトル | 研究課題番号 |
|---|---|---|
| 科学研究費助成事業 基盤研究（C） | 腎癌における遺伝子変異・遺伝子発現を基にした治療体系確立への基礎研究 | 16K11035 |
| 喫煙科学研究財団 | 腎癌における遺伝子変異・発現異常を基にした治療体系確立への基礎研究 | - |
関連論文
| タイトル | DOI | データID | |
|---|---|---|---|
| 1 | ADP-ribosylation factor-like 4C is a predictive biomarker of poor prognosis in patients with renal cell carcinoma | PMID: 30906638 |
JGAD000223 JGAD000224 JGAD000225 |
| 2 |
制限公開データの利用者一覧
| 研究代表者 | 所属機関 | 国・州名 | 研究題目 | 利用データID | 利用期間 |
|---|---|---|---|---|---|
